Amgalan B.Sc., Batchuluun
Thema:Entwicklung eines MATLAB basierten Programms zur einfachen Vorverarbeitung und Analyse von Massenspektrometerdaten
Betreuer:Prof. Dr.rer.nat B. Wirnitzer
2. Betreuer:Dipl.-Ing. Matthias Schwartz
Beschreibung:Im Rahmen des ZAFH Forschungsprojekts ABIMAS sollen
mehrdimensionale Sensordaten von einem MALDI
(Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization)
Massenspektrometer verarbeitet werden. Ein wichtiges
Ziel hierbei ist die Klassifikation der Messdaten.
 
Eine typische MALDI Messung besteht aus einem
Intensitätsverlauf in Abhängigkeit zum Verhältnis Masse
zu Ladung (m/z). Dieser Verlauf soll mit anderen Messwerten
verglichen werden. Es soll ein Klassifikationsverfahren
realisiert werden, mit dessen Hilfe die vorliegenden
Messungen unterschieden werden können. Hierzu ist ein
einfach zu bedienendes Programm zu erstellen. Dieses soll
folgende Funktionalität umfassen:
  1. Einfache Bedienoberfläche (MATLAB GUI)
  2. Integration der vorhandenen Vorverarbeitungsalgorithmen
  3. Merkmalsextraktion aus den Spektren (Peak Picking). Infos...
  4. Berechnung und Visualisierung verschiedener       Ähnlichkeitsmaße der verschiedenen Messungen
Folgende Aufgabenstellungen sind zu bearbeiten:
  • Klassifikation der Spektren mit vorhandener kommerzieller Software (clinprotools)
  • Konvertierung des MATLAB Programms in eine eigenständig lauffähige Version
  • Vergleich zwischen Bruker Programm (clinprotools) und der eigenen MATLAB Implementierung anhand der vorliegenden Daten